※ 本文為 MindOcean 轉寄自 ptt.cc 更新時間: 2020-02-01 09:58:53
看板 Gossiping
作者 標題 Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
時間 Sat Feb 1 06:23:23 2020
※ 引述《jonsauwi (JBY)》之銘言：
: 今天剛好老闆對這有興趣要我們查sequence，
: 所以拿起已經查的東西來對了一下發現根本對不到HIV的序列，
: 於是直接拿HIV-1 gp120的序列來找一下該論文裡的序列。
: 我用的gp120序列accession number: NP_579894.2
: 結果文章裡的三個insert序列中，
: insert 1、insert 2完全不存在於我用的序列data裡，
: insert 3有對到但大概是像下面這樣↓
: NP_579894.2 104 TDLKNDTNTNSSSG 117
: T L N+T NSSSG
: 論文序列 2 TYLFNETRGNSSSG 15
: identities：64%，勉勉強強但又覺得挺不像...
: 至於gag那個我還沒有去對。
: 文章裡寫說他使用的HIV-1的序列放在supp. table 1裡，
: 但是我找不到這個table，請問有人知道他到底用哪個序列對出來的嗎？
不用找序列來對,拿去blastp就有了
確實4條個都 HIV-1 來的
https://imgur.com/a/WlTwUS2.jpg
![[圖]](https://i.imgur.com/gyGKERo.png)
不過不用擔心跟HIV一樣沒救
gp120, gap 都只跟侵入宿主細胞的機制有關
中標了,他就只是個冠狀病毒
...
靠杯,還有幾天能逃?
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 116.231.2.134 (中國)
※ 文章代碼(AID): #1UDAZVSG (Gossiping)
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Gossiping/M.1580509407.A.710.html
※ 同主題文章:
02-01 04:16 ■ [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 05:02 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 05:38 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
● 02-01 06:23 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 06:23 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 07:38 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-03 00:35 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
→ tyuk …
推 : 所以呢？ 有沒有一句話版本的結論？3F 39.9.201.47 台灣 02/01 06:26
推 : 台灣生科學生真的要加油啦4F 36.224.52.84 台灣 02/01 06:26
→ : "不用擔心"後面那個逗號是不小心按到的5F 114.136.195.63 台灣 02/01 06:26
→ : 嗎？
→ : 嗎？
→ : 你在中國衝三小7F 180.177.131.174 台灣 02/01 06:27
→ : 所以到底是有沒有救啊？8F 39.9.201.47 台灣 02/01 06:27
→ : 阿你也快逃啊 在中國欉三小
→ : 阿你也快逃啊 在中國欉三小
→ : 有無那個逗號意思完全不同呢。10F 114.136.195.63 台灣 02/01 06:27
→ : 應該是習慣按了逗號...11F 116.231.2.134 中國 02/01 06:29
→ : 就瘟疫公司遊戲裡 增加傳染力的點數12F 3.90.219.84 美國 02/01 06:29
→ : 有救的13F 116.231.2.134 中國 02/01 06:29
※ 編輯: supray (116.231.2.134 中國), 02/01/2020 06:31:27推 : 推14F 223.141.12.25 台灣 02/01 06:30
推 : 來不及了 逃不了了15F 220.135.66.98 台灣 02/01 06:30
推 : 剛剛比對了我的序列跟你列的序列，好像16F 123.194.172.116 台灣 02/01 06:32
→ : 我比不到的剛好都在差異特大的地方耶
→ : 我比不到的剛好都在差異特大的地方耶
推 : 你該不會是個醫科生吧18F 59.115.123.156 台灣 02/01 06:32
→ : 混口飯吃,不想中標呀...19F 116.231.2.134 中國 02/01 06:32
→ : 另外，insert 1~3明明同是gp120，用的卻20F 123.194.172.116 台灣 02/01 06:37
→ : 是不同accession number的序列
→ : 是不同accession number的序列
→ : 有這序列符合100%不只一條,我只是挑第一個22F 116.231.2.134 中國 02/01 06:42
→ : 是個科科生
→ : 是個科科生
推 : RIP24F 36.226.246.125 台灣 02/01 06:46
推 : 簡單來說，找到跟冠狀病毒不同的片段25F 143.48.85.134 美國 02/01 06:52
→ : 然後想辦法合理化
→ : 然後想辦法合理化
推 : 剛稍微對了一下 insert1,3好像是結構27F 140.112.121.122 台灣 02/01 06:58
→ : 中同一個flexible區域 insert2 在靠
→ : 近CD4 interaction region
→ : 中同一個flexible區域 insert2 在靠
→ : 近CD4 interaction region
推 : 所以有討論出結論嗎 到底有沒有一樣30F 123.194.177.132 台灣 02/01 07:07
→ : 只要有機率自然發生,中共不可能會揹這鍋的31F 116.231.2.134 中國 02/01 07:20
→ : 所以不可能有結論呀
→ : 所以不可能有結論呀
→ : 現在好像是連"論文"是否可靠都沒結論吧？33F 27.242.62.194 台灣 02/01 07:21
推 : 除非有P4組員良心發現出來作證34F 39.10.202.192 台灣 02/01 07:37
推 : 學術期刊本身就是雜誌性質的東西。想成35F 223.141.12.25 台灣 02/01 07:43
→ : 高級版的小牛頓就好。只是找到人幫你背
→ : 書(同行審查)，最後還是要送到大眾面前
→ : 審視，有專家背書最後也不見得是對的。
→ : 預印本則是跳過同行審查先給大眾審視。
→ : 嚴格來說論文可不可靠只能等學界看過的
→ : 心得來判斷。哈佛幹細胞那些經同行審查
→ : 的“可靠”論文還不是被踢爆造假。有些
→ : 世界級研究甚至一直都是預印本的狀態沒
→ : 正式發表。結論就是只能等其他大佬的讀
→ : 後感。
→ : 高級版的小牛頓就好。只是找到人幫你背
→ : 書(同行審查)，最後還是要送到大眾面前
→ : 審視，有專家背書最後也不見得是對的。
→ : 預印本則是跳過同行審查先給大眾審視。
→ : 嚴格來說論文可不可靠只能等學界看過的
→ : 心得來判斷。哈佛幹細胞那些經同行審查
→ : 的“可靠”論文還不是被踢爆造假。有些
→ : 世界級研究甚至一直都是預印本的狀態沒
→ : 正式發表。結論就是只能等其他大佬的讀
→ : 後感。
推 : !46F 114.32.210.239 台灣 02/01 09:43
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