本刊接獲爆料，台大環工所長林正芳不甩校規，執意賤價冠名環工所系館大樓，本刊為了查證爆料內容，十一日實地走訪台大環工所，建築物上方原本的「納諾環境館」五個大字，竟被紅布蓋上，外觀上完全看不出有被冠名的痕跡。比照八月五日才才風光揭牌的場景，現場情況格外詭譎異常。

記者上樓詢問所長，但環工所所長林正芳一聽到記者提及納諾公司，便起身趕人，記者質疑捐贈金額不足，卻讓企業冠名整棟系館是否牴觸校規時，林正芳更是怒髮衝冠，直接將記者請出辦公室。爾後，林正芳找來了一名自稱畢業校友、滿頭白髮的何姓男子，前來阻擋記者採訪，這名白髮男一邊假意請記者喝水，林正芳則趁隙想從旁離開。本刊記者見狀趨前詢問：「所長，所內被爆料違反校規，是不是有什麼誤會的地方，可以解釋一下嗎？」沒想到記者的問話都還沒結束，白髮男就把本刊攝影記者整個人抱了起來，甚至企圖以柔道大外割方式，將攝影記者摔倒在地，記者差

此時，林正芳突然狼狽逃竄欲離開現場，記者解釋來意並表示是接獲投訴才前來查證，但林正芳一句話都不願意說，撇了頭瞪了記者一眼，便躲進所長辦公室。而白髮男子則多次進出所長辦公室和記者居中協調，期間還告訴記者：「那五千萬元其實是（呂鴻圖）個人捐贈跟納諾無關。」僵持許久後，林正芳走出所長室，仍不願意正面回應相關問題。記者追問：「如果五千萬是個人捐贈，是不是更不應該使用『納諾環境館』來冠名？」

林正芳聽聞後，要求記者擇期另行提交採訪大綱，再傳真到所長室，他才願意回答。接下來，面對記者其他問題全部拒答，只是跳針般地複誦所長室的傳真電話，最後則是騎上腳踏車揚長而去。拒絕說明納諾冠名爭議的所長林正芳，外界評價毀譽參半。二○○七年，檢調執行「學術掃黑」，檢調當場查獲台大環工所的林正芳等四名教授，涉嫌接受昭凌公司喝花酒、性招待等來洩漏工程底價，林正芳遭《貪污治罪條例》起訴，一審更被重判十年二個月，之後翻盤逆轉無罪定讞，才接任環工所所長。